Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA3P26006 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms