Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA6P23229 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms