Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB1P20618 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB1P20618 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms