Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCNA2P20248 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms