Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B1P20020 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B1P20020 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B1P20020 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B1P20020 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B1P20020 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B1P20020 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B1P20020 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms