Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCLP19338 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NCLP19338 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCLP19338 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCLP19338 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms