Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB4P17483 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms