Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms