Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM27P14373 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms