Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT13P13646 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT13P13646 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT13P13646 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT13P13646 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT13P13646 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT13P13646 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRT13P13646 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRT13P13646 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT13P13646 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT13P13646 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms