Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms