Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOP08100 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RHOP08100 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOP08100 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOP08100 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms