Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTSLP07711 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTSLP07711 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms