Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSF1RP07333 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1RP07333 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms