Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHEP01854 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHEP01854 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHEP01854 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHEP01854 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHEP01854 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHEP01854 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHEP01854 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHEP01854 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms