Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POP4O95707 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POP4O95707 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POP4O95707 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POP4O95707 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POP4O95707 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POP4O95707 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POP4O95707 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
POP4O95707 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POP4O95707 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POP4O95707 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POP4O95707 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POP4O95707 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POP4O95707 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POP4O95707 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
POP4O95707 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POP4O95707 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POP4O95707 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POP4O95707 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POP4O95707 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POP4O95707 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POP4O95707 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POP4O95707 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POP4O95707 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POP4O95707 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POP4O95707 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms