Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC24BO95487 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms