Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MBD4O95243 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD4O95243 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD4O95243 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD4O95243 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms