Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F6O75461 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2F6O75461 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms