Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM4AO75164 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDM4AO75164 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms