Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms