Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STX6O43752 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
STX6O43752 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STX6O43752 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STX6O43752 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
STX6O43752 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STX6O43752 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX6O43752 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX6O43752 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX6O43752 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX6O43752 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
STX6O43752 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX6O43752 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STX6O43752 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms