Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KDELR3O43731 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms