Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNQ3O43525 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNQ3O43525 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms