Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FABP7O15540 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FABP7O15540 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FABP7O15540 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FABP7O15540 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FABP7O15540 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FABP7O15540 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FABP7O15540 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FABP7O15540 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FABP7O15540 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FABP7O15540 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FABP7O15540 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FABP7O15540 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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