Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBDO15205 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBDO15205 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBDO15205 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms