Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CEP290O15078 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CEP290O15078 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CEP290O15078 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP290O15078 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP290O15078 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP290O15078 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP290O15078 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP290O15078 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CEP290O15078 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP290O15078 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP290O15078 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP290O15078 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CEP290O15078 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CEP290O15078 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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