Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3EO15041 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms