Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
E2F3O00716 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2F3O00716 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2F3O00716 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
E2F3O00716 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms