Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOC4-APOC2K7ER74 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms