Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
J3KR12 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KR12 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KR12 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KR12 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KR12 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KR12 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KR12 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KR12 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KR12 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KR12 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KR12 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
J3KR12 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
J3KR12 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
J3KR12 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms