Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCER2I3L3R5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCER2I3L3R5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms