Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRDCB7Z8K6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRDCB7Z8K6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms