Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B4DXG7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B4DXG7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DXG7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
B4DXG7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DXG7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DXG7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DXG7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DXG7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DXG7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms