Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM5B3KS81 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms