Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMGB1P1B2RPK0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMGB1P1B2RPK0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms