Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC00587B1AMM8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms