Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXI3A8MTJ6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms