Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERINC4A6NH21 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms