Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6CA6NDK9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA6CA6NDK9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms