Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PALM3A6NDB9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms