Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMB4A4D0S4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms