Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IRGMA1A4Y4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms