Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms