Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms