Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms