Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PNMA8BQ9ULN7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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