Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRPF3Q9ULD4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRPF3Q9ULD4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms