Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEFF2Q9UIK5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEFF2Q9UIK5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms