Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFMBT1Q9UHJ3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms